Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
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