Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2B3Q16720 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
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