Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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