Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms