Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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