Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBM39Q14498 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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