Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNQ14247 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNQ14247 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms