Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
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