Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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C1orf61Q13536 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
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