Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXO1Q12778 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FOXO1Q12778 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FOXO1Q12778 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FOXO1Q12778 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXO1Q12778 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXO1Q12778 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXO1Q12778 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXO1Q12778 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms