Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 ARO4YBR249C 1113 nt2.59□□□□□ -1.99
ATG41Q12048 YIL169CYIL169C 2988 nt2.59□□□□□ -2
ATG41Q12048 PCL10YGL134W 1302 nt2.59□□□□□ -2
ATG41Q12048 FAS1YKL182W 6156 nt2.58□□□□□ -2
ATG41Q12048 PGS1YCL004W 1566 nt2.58□□□□□ -2
ATG41Q12048 MOB2YFL034C-B 864 nt2.58□□□□□ -2
ATG41Q12048 PNC1YGL037C 651 nt2.58□□□□□ -2
ATG41Q12048 SNL1YIL016W 480 nt2.58□□□□□ -2
ATG41Q12048 POG1YIL122W 1056 nt2.58□□□□□ -2
ATG41Q12048 YMR084WYMR084W 789 nt2.58□□□□□ -2
ATG41Q12048 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.58□□□□□ -2
ATG41Q12048 PSF3YOL146W 585 nt2.58□□□□□ -2
ATG41Q12048 YOR186WYOR186W 435 nt2.58□□□□□ -2
ATG41Q12048 snR42snR42 351 nt2.58□□□□□ -2
ATG41Q12048 UTP25YIL091C 2166 nt2.58□□□□□ -2
ATG41Q12048 PWP2YCR057C 2772 nt2.58□□□□□ -2
ATG41Q12048 SYT1YPR095C 3681 nt2.57□□□□□ -2
ATG41Q12048 TCP1YDR212W 1680 nt2.57□□□□□ -2
ATG41Q12048 CBP2YHL038C 1893 nt2.57□□□□□ -2
ATG41Q12048 YDR282CYDR282C 1245 nt2.57□□□□□ -2
ATG41Q12048 FMC1YIL098C 468 nt2.57□□□□□ -2
ATG41Q12048 PIR1YKL164C 1026 nt2.57□□□□□ -2
ATG41Q12048 TDA8YAL064C-A 381 nt2.57□□□□□ -2
ATG41Q12048 RPL6AYML073C 531 nt2.57□□□□□ -2
ATG41Q12048 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt2.57□□□□□ -2
ATG41Q12048 ANT1YPR128C 987 nt2.57□□□□□ -2
ATG41Q12048 RIF1YBR275C 5751 nt2.57□□□□□ -2
ATG41Q12048 SEC27YGL137W 2670 nt2.57□□□□□ -2
ATG41Q12048 PRP3YDR473C 1410 nt2.57□□□□□ -2
ATG41Q12048 SER3YER081W 1410 nt2.57□□□□□ -2
ATG41Q12048 SPO77YLR341W 1434 nt2.57□□□□□ -2
ATG41Q12048 ILS1YBL076C 3219 nt2.57□□□□□ -2
ATG41Q12048 CPA2YJR109C 3357 nt2.57□□□□□ -2
ATG41Q12048 SNQ2YDR011W 4506 nt2.56□□□□□ -2
ATG41Q12048 RTK1YDL025C 1863 nt2.56□□□□□ -2
ATG41Q12048 AST2YER101C 1293 nt2.56□□□□□ -2
ATG41Q12048 MRPS35YGR165W 1038 nt2.56□□□□□ -2
ATG41Q12048 CLC1YGR167W 702 nt2.56□□□□□ -2
ATG41Q12048 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.56□□□□□ -2
ATG41Q12048 YAR069CYAR069C 294 nt2.56□□□□□ -2
ATG41Q12048 FBP26YJL155C 1359 nt2.56□□□□□ -2
ATG41Q12048 GIS4YML006C 2325 nt2.56□□□□□ -2
ATG41Q12048 PFF1YBR074W 2931 nt2.55□□□□□ -2
ATG41Q12048 ISM1YPL040C 3009 nt2.55□□□□□ -2
ATG41Q12048 MIX14YDR031W 366 nt2.55□□□□□ -2
ATG41Q12048 MRH1YDR033W 963 nt2.55□□□□□ -2
ATG41Q12048 OKP1YGR179C 1221 nt2.55□□□□□ -2
ATG41Q12048 MUP3YHL036W 1641 nt2.55□□□□□ -2
ATG41Q12048 IRC18YJL037W 675 nt2.55□□□□□ -2
ATG41Q12048 MAK16YAL025C 921 nt2.55□□□□□ -2
ATG41Q12048 BUD4YJR092W 4344 nt2.55□□□□□ -2
ATG41Q12048 SSO2YMR183C 888 nt2.55□□□□□ -2
ATG41Q12048 MUM3YOR298W 1440 nt2.55□□□□□ -2
ATG41Q12048 ALG1YBR110W 1350 nt2.55□□□□□ -2
ATG41Q12048 LRG1YDL240W 3054 nt2.55□□□□□ -2
ATG41Q12048 SLM2YNL047C 1971 nt2.54□□□□□ -2
ATG41Q12048 CAF130YGR134W 3369 nt2.54□□□□□ -2
ATG41Q12048 MOT1YPL082C 5604 nt2.54□□□□□ -2
ATG41Q12048 IMH1YLR309C 2736 nt2.54□□□□□ -2
ATG41Q12048 MTH1YDR277C 1302 nt2.54□□□□□ -2
ATG41Q12048 RCR2YDR003W 633 nt2.54□□□□□ -2
ATG41Q12048 MRPL24YMR193W 777 nt2.54□□□□□ -2
ATG41Q12048 NCE103YNL036W 666 nt2.54□□□□□ -2
ATG41Q12048 RIB5YBR256C 717 nt2.54□□□□□ -2
ATG41Q12048 SEC7YDR170C 6030 nt2.54□□□□□ -2
ATG41Q12048 GYP7YDL234C 2241 nt2.54□□□□□ -2
ATG41Q12048 YKL222CYKL222C 2118 nt2.54□□□□□ -2
ATG41Q12048 KAP104YBR017C 2757 nt2.54□□□□□ -2
ATG41Q12048 ETP1YHL010C 1758 nt2.54□□□□□ -2
ATG41Q12048 TLC1TLC1 1301 nt2.53□□□□□ -2
ATG41Q12048 NEM1YHR004C 1341 nt2.53□□□□□ -2
ATG41Q12048 RNY1YPL123C 1305 nt2.53□□□□□ -2
ATG41Q12048 RGC1YPR115W 3252 nt2.53□□□□□ -2
ATG41Q12048 PEF1YGR058W 1008 nt2.53□□□□□ -2
ATG41Q12048 ERD2YBL040C 660 nt2.53□□□□□ -2
ATG41Q12048 YPR050CYPR050C 414 nt2.53□□□□□ -2
ATG41Q12048 YOR296WYOR296W 3870 nt2.53□□□□□ -2
ATG41Q12048 PRS5YOL061W 1491 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG41Q12048 RAD4YER162C 2265 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG41Q12048 YBR238CYBR238C 2196 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG41Q12048 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG41Q12048 DOS2YDR068W 933 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG41Q12048 YDR491CYDR491C 492 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG41Q12048 COS8YHL048W 1146 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG41Q12048 YIL174WYIL174W 228 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG41Q12048 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG41Q12048 TIS11YLR136C 858 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG41Q12048 CPR3YML078W 549 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG41Q12048 RPC34YNR003C 954 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG41Q12048 ECM21YBL101C 3354 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG41Q12048 ROG1YGL144C 2058 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG41Q12048 BPT1YLL015W 4680 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG41Q12048 EPO1YMR124W 2832 nt2.51□□□□□ -2.01
ATG41Q12048 YDR149CYDR149C 708 nt2.51□□□□□ -2.01
ATG41Q12048 PFA5YDR459C 1125 nt2.51□□□□□ -2.01
ATG41Q12048 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt2.51□□□□□ -2.01
ATG41Q12048 LST7YGR057C 729 nt2.51□□□□□ -2.01
ATG41Q12048 SIL1YOL031C 1266 nt2.51□□□□□ -2.01
ATG41Q12048 YOL079WYOL079W 399 nt2.51□□□□□ -2.01
ATG41Q12048 RPL33AYPL143W 324 nt2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30 ms