Protein–RNA interactions for Protein: Q08474

VAM10, Vacuolar morphogenesis protein 10, yeastyeast

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM10Q08474 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 YER138CYER138C 5268 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 YER160CYER160C 5268 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 YJR027WYJR027W 5268 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 YML039WYML039W 5268 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 YML045WYML045W 5268 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 YMR050CYMR050C 5268 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 KAP95YLR347C 2586 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 SPB4YFL002C 1821 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 YMR018WYMR018W 1545 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 PFA5YDR459C 1125 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 YIL025CYIL025C 375 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 PHD1YKL043W 1101 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 SHE3YBR130C 1278 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 RIB5YBR256C 717 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 DRS2YAL026C 4068 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 YPS6YIR039C 1614 nt2.24□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 SLM2YNL047C 1971 nt2.23□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 ERG9YHR190W 1335 nt2.23□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 RNY1YPL123C 1305 nt2.23□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 SEC7YDR170C 6030 nt2.23□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 RTK1YDL025C 1863 nt2.23□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 POL31YJR006W 1464 nt2.23□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 QRI7YDL104C 1224 nt2.23□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 YDL242WYDL242W 354 nt2.23□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.23□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.23□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.23□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 RPC37YKR025W 849 nt2.23□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 AHP1YLR109W 531 nt2.23□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.23□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 TPK2YPL203W 1143 nt2.23□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 TMA108YIL137C 2841 nt2.23□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 EPO1YMR124W 2832 nt2.23□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 FUN30YAL019W 3396 nt2.23□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 YAK1YJL141C 2424 nt2.22□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 MIC60YKR016W 1623 nt2.22□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 YER039C-AYER039C-A 219 nt2.22□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 ERV14YGL054C 417 nt2.22□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 YHL005CYHL005C 393 nt2.22□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 QCR10YHR001W-A 234 nt2.22□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 RPN1YHR027C 2982 nt2.22□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 APC9YLR102C 798 nt2.22□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 CPR3YML078W 549 nt2.22□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 SEC14YMR079W 915 nt2.22□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 MRPL16YBL038W 699 nt2.22□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 ERD2YBL040C 660 nt2.22□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 VAM10YOR068C 345 nt2.22□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 RPS7AYOR096W 573 nt2.22□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 OXR1YPL196W 822 nt2.22□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 ARO4YBR249C 1113 nt2.22□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 MRPL37YBR268W 318 nt2.22□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 JJJ1YNL227C 1773 nt2.22□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 YBR138CYBR138C 1575 nt2.22□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 FBP26YJL155C 1359 nt2.22□□□□□ -2.05
VAM10Q08474 SET1YHR119W 3243 nt2.21□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 COM2YER130C 1332 nt2.21□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 PPH3YDR075W 927 nt2.21□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 HDA2YDR295C 2025 nt2.21□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 FMC1YIL098C 468 nt2.21□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 YIR040CYIR040C 333 nt2.21□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 LSM1YJL124C 519 nt2.21□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 MRPL24YMR193W 777 nt2.21□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 OCA2YNL056W 594 nt2.21□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 RPC34YNR003C 954 nt2.21□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 RPL20BYOR312C 519 nt2.21□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 YPR077CYPR077C 372 nt2.21□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 BPT1YLL015W 4680 nt2.2□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 YKL222CYKL222C 2118 nt2.2□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 APN2YBL019W 1563 nt2.2□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 WHI4YDL224C 1950 nt2.2□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 YGR117CYGR117C 1431 nt2.2□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 BMH2YDR099W 822 nt2.2□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 HAT2YEL056W 1206 nt2.2□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 COS8YHL048W 1146 nt2.2□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 SNL1YIL016W 480 nt2.2□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 TTI2YJR136C 1266 nt2.2□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 SDH3YKL141W 597 nt2.2□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 SFH1YLR321C 1281 nt2.2□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 RPN13YLR421C 471 nt2.2□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 RPL6AYML073C 531 nt2.2□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.2□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 YIL092WYIL092W 1902 nt2.2□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 ETP1YHL010C 1758 nt2.2□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 YPL109CYPL109C 1974 nt2.19□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 FAR1YJL157C 2493 nt2.19□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 VPS17YOR132W 1656 nt2.19□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 MIG1YGL035C 1515 nt2.19□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 DOS2YDR068W 933 nt2.19□□□□□ -2.06
VAM10Q08474 LIF1YGL090W 1266 nt2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.4 ms