Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN12Q05209 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN12Q05209 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms