Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 YVH1YIR026C 1095 nt2.91□□□□□ -1.94
NUP49Q02199 YJR111CYJR111C 852 nt2.91□□□□□ -1.94
NUP49Q02199 RPC37YKR025W 849 nt2.91□□□□□ -1.94
NUP49Q02199 YBL065WYBL065W 345 nt2.91□□□□□ -1.94
NUP49Q02199 YOL079WYOL079W 399 nt2.91□□□□□ -1.94
NUP49Q02199 PEX11YOL147C 711 nt2.91□□□□□ -1.94
NUP49Q02199 SAS5YOR213C 747 nt2.91□□□□□ -1.94
NUP49Q02199 YBR053CYBR053C 1077 nt2.91□□□□□ -1.94
NUP49Q02199 MET16YPR167C 786 nt2.91□□□□□ -1.94
NUP49Q02199 OPY1YBR129C 987 nt2.91□□□□□ -1.94
NUP49Q02199 SPO71YDR104C 3738 nt2.91□□□□□ -1.94
NUP49Q02199 LRG1YDL240W 3054 nt2.9□□□□□ -1.94
NUP49Q02199 VPS17YOR132W 1656 nt2.9□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 LST7YGR057C 729 nt2.9□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 RPS23AYGR118W 438 nt2.9□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 SNL1YIL016W 480 nt2.9□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 YMR141CYMR141C 309 nt2.9□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 IMP4YNL075W 873 nt2.9□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 RPS23BYPR132W 438 nt2.9□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 RCY1YJL204C 2523 nt2.9□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 GCD6YDR211W 2139 nt2.9□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 CUE3YGL110C 1875 nt2.9□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 EMP70YLR083C 2004 nt2.9□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 STP2YHR006W 1626 nt2.9□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 PRR2YDL214C 2100 nt2.89□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 CLB3YDL155W 1284 nt2.89□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 RRP17YDR412W 708 nt2.89□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 FMP32YFL046W 624 nt2.89□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 EMG1YLR186W 759 nt2.89□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 SFH1YLR321C 1281 nt2.89□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 NCE103YNL036W 666 nt2.89□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 ANT1YPR128C 987 nt2.89□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 FES1YBR101C 873 nt2.89□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 UBP14YBR058C 2346 nt2.88□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 CDC40YDR364C 1368 nt2.88□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 FBP26YJL155C 1359 nt2.88□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 ARO1YDR127W 4767 nt2.88□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 MAK21YDR060W 3078 nt2.88□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 YGL214WYGL214W 486 nt2.88□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 BUR2YLR226W 1188 nt2.88□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 YMR084WYMR084W 789 nt2.88□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.88□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 ERD2YBL040C 660 nt2.88□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 DIM1YPL266W 957 nt2.88□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 MRPL51YPR100W 423 nt2.88□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 GIS4YML006C 2325 nt2.88□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 TEC1YBR083W 1461 nt2.88□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 BCH1YMR237W 2175 nt2.88□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 CUS1YMR240C 1311 nt2.88□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 YDR089WYDR089W 2610 nt2.88□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 ARG2YJL071W 1725 nt2.88□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 AKR1YDR264C 2295 nt2.88□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 GYP6YJL044C 1377 nt2.87□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 DOS2YDR068W 933 nt2.87□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 PDS1YDR113C 1122 nt2.87□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 AHP1YLR109W 531 nt2.87□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 TDA3YHR009C 1572 nt2.87□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 YVC1YOR087W 2028 nt2.86□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 CHO2YGR157W 2610 nt2.86□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 DSN1YIR010W 1731 nt2.86□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 YCL068CYCL068C 783 nt2.86□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 APA2YDR530C 978 nt2.86□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 MOB2YFL034C-B 864 nt2.86□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 QCR10YHR001W-A 234 nt2.86□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 SDS3YIL084C 984 nt2.86□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 DAL2YIR029W 1032 nt2.86□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 COQ9YLR201C 783 nt2.86□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 UNG1YML021C 1080 nt2.86□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 NIP7YPL211W 546 nt2.86□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 MRPL37YBR268W 318 nt2.86□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 TFC1YBR123C 1950 nt2.86□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 BUD4YJR092W 4344 nt2.86□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 RNY1YPL123C 1305 nt2.86□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 YTA7YGR270W 4140 nt2.86□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 FLO1YAR050W 4614 nt2.86□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 RRM3YHR031C 2172 nt2.85□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 TDA1YMR291W 1761 nt2.85□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 PMR1YGL167C 2853 nt2.85□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 TIF4631YGR162W 2859 nt2.85□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 SNQ2YDR011W 4506 nt2.85□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.85□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 BUD21YOR078W 645 nt2.85□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 COM2YER130C 1332 nt2.85□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 FKH2YNL068C 2589 nt2.85□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 ATG26YLR189C 3597 nt2.85□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 NOP4YPL043W 2058 nt2.84□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.84□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.84□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.84□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.84□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.84□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.84□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.84□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.84□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 YIL086CYIL086C 309 nt2.84□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 RPS21BYJL136C 264 nt2.84□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 ATP12YJL180C 978 nt2.84□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 MTR2YKL186C 555 nt2.84□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 GTT2YLL060C 702 nt2.84□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 CPR3YML078W 549 nt2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.8 ms