Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms