Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIM1P81133 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIM1P81133 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIM1P81133 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIM1P81133 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SIM1P81133 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIM1P81133 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIM1P81133 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIM1P81133 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIM1P81133 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIM1P81133 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIM1P81133 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIM1P81133 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIM1P81133 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIM1P81133 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SIM1P81133 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SIM1P81133 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIM1P81133 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SIM1P81133 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SIM1P81133 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIM1P81133 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIM1P81133 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIM1P81133 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIM1P81133 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIM1P81133 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIM1P81133 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SIM1P81133 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIM1P81133 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIM1P81133 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIM1P81133 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIM1P81133 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIM1P81133 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIM1P81133 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIM1P81133 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIM1P81133 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIM1P81133 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIM1P81133 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIM1P81133 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIM1P81133 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIM1P81133 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIM1P81133 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIM1P81133 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIM1P81133 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIM1P81133 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIM1P81133 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIM1P81133 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIM1P81133 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIM1P81133 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIM1P81133 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIM1P81133 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIM1P81133 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIM1P81133 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIM1P81133 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIM1P81133 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIM1P81133 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SIM1P81133 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIM1P81133 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIM1P81133 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIM1P81133 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIM1P81133 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIM1P81133 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIM1P81133 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIM1P81133 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIM1P81133 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIM1P81133 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIM1P81133 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIM1P81133 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SIM1P81133 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SIM1P81133 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIM1P81133 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIM1P81133 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIM1P81133 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIM1P81133 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIM1P81133 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIM1P81133 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIM1P81133 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIM1P81133 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIM1P81133 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIM1P81133 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIM1P81133 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIM1P81133 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SIM1P81133 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIM1P81133 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIM1P81133 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIM1P81133 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIM1P81133 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIM1P81133 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIM1P81133 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIM1P81133 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIM1P81133 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIM1P81133 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIM1P81133 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIM1P81133 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIM1P81133 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIM1P81133 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIM1P81133 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIM1P81133 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIM1P81133 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIM1P81133 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIM1P81133 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms