Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARF6P62330 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARF6P62330 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARF6P62330 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARF6P62330 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARF6P62330 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARF6P62330 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARF6P62330 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARF6P62330 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF6P62330 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF6P62330 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF6P62330 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF6P62330 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF6P62330 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF6P62330 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF6P62330 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF6P62330 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF6P62330 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF6P62330 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF6P62330 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF6P62330 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF6P62330 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF6P62330 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF6P62330 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF6P62330 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF6P62330 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF6P62330 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF6P62330 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARF6P62330 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF6P62330 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF6P62330 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF6P62330 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF6P62330 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF6P62330 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF6P62330 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF6P62330 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF6P62330 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF6P62330 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF6P62330 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF6P62330 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF6P62330 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF6P62330 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF6P62330 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF6P62330 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF6P62330 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF6P62330 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF6P62330 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF6P62330 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARF6P62330 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF6P62330 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF6P62330 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF6P62330 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF6P62330 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF6P62330 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF6P62330 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF6P62330 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF6P62330 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF6P62330 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF6P62330 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF6P62330 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF6P62330 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF6P62330 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF6P62330 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF6P62330 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF6P62330 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF6P62330 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF6P62330 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF6P62330 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF6P62330 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARF6P62330 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms