Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RPS29P62273 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RPS29P62273 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RPS29P62273 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RPS29P62273 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RPS29P62273 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RPS29P62273 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RPS29P62273 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RPS29P62273 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RPS29P62273 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
RPS29P62273 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RPS29P62273 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
RPS29P62273 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
RPS29P62273 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
RPS29P62273 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RPS29P62273 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RPS29P62273 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RPS29P62273 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RPS29P62273 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RPS29P62273 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RPS29P62273 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RPS29P62273 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RPS29P62273 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RPS29P62273 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RPS29P62273 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RPS29P62273 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RPS29P62273 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RPS29P62273 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RPS29P62273 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RPS29P62273 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RPS29P62273 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RPS29P62273 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RPS29P62273 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RPS29P62273 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RPS29P62273 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RPS29P62273 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RPS29P62273 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RPS29P62273 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RPS29P62273 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RPS29P62273 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RPS29P62273 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RPS29P62273 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RPS29P62273 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RPS29P62273 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RPS29P62273 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RPS29P62273 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RPS29P62273 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RPS29P62273 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RPS29P62273 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RPS29P62273 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RPS29P62273 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RPS29P62273 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RPS29P62273 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RPS29P62273 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RPS29P62273 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RPS29P62273 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RPS29P62273 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RPS29P62273 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RPS29P62273 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RPS29P62273 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RPS29P62273 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RPS29P62273 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RPS29P62273 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RPS29P62273 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RPS29P62273 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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