Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
EIF3EP60228 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms