Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms