Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRPF1P55201 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRPF1P55201 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRPF1P55201 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BRPF1P55201 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.57■■■□□ 2
BRPF1P55201 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BRPF1P55201 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRPF1P55201 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRPF1P55201 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRPF1P55201 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRPF1P55201 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRPF1P55201 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BRPF1P55201 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRPF1P55201 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRPF1P55201 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BRPF1P55201 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
BRPF1P55201 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BRPF1P55201 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRPF1P55201 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BRPF1P55201 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRPF1P55201 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRPF1P55201 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BRPF1P55201 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRPF1P55201 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRPF1P55201 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
BRPF1P55201 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BRPF1P55201 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BRPF1P55201 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRPF1P55201 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BRPF1P55201 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRPF1P55201 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BRPF1P55201 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRPF1P55201 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BRPF1P55201 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRPF1P55201 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRPF1P55201 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRPF1P55201 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRPF1P55201 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRPF1P55201 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRPF1P55201 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BRPF1P55201 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRPF1P55201 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRPF1P55201 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRPF1P55201 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BRPF1P55201 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRPF1P55201 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRPF1P55201 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRPF1P55201 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRPF1P55201 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRPF1P55201 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRPF1P55201 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BRPF1P55201 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BRPF1P55201 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BRPF1P55201 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BRPF1P55201 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BRPF1P55201 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
BRPF1P55201 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BRPF1P55201 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRPF1P55201 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BRPF1P55201 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BRPF1P55201 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRPF1P55201 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRPF1P55201 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BRPF1P55201 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BRPF1P55201 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRPF1P55201 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
BRPF1P55201 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BRPF1P55201 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BRPF1P55201 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRPF1P55201 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRPF1P55201 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRPF1P55201 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRPF1P55201 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BRPF1P55201 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.51■■■□□ 2
BRPF1P55201 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.51■■■□□ 2
BRPF1P55201 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
BRPF1P55201 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms