Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PGDP52209 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGDP52209 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGDP52209 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGDP52209 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGDP52209 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGDP52209 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGDP52209 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGDP52209 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGDP52209 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGDP52209 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGDP52209 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGDP52209 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGDP52209 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGDP52209 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGDP52209 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGDP52209 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGDP52209 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGDP52209 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGDP52209 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGDP52209 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGDP52209 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGDP52209 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGDP52209 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGDP52209 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGDP52209 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGDP52209 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGDP52209 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGDP52209 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGDP52209 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGDP52209 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGDP52209 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGDP52209 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGDP52209 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGDP52209 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGDP52209 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGDP52209 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PGDP52209 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PGDP52209 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGDP52209 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGDP52209 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGDP52209 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGDP52209 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGDP52209 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGDP52209 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGDP52209 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PGDP52209 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGDP52209 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGDP52209 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGDP52209 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGDP52209 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PGDP52209 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGDP52209 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGDP52209 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGDP52209 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PGDP52209 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGDP52209 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGDP52209 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGDP52209 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGDP52209 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGDP52209 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGDP52209 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGDP52209 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGDP52209 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGDP52209 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGDP52209 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGDP52209 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGDP52209 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGDP52209 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PGDP52209 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGDP52209 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PGDP52209 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PGDP52209 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGDP52209 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGDP52209 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PGDP52209 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGDP52209 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGDP52209 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGDP52209 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGDP52209 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGDP52209 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGDP52209 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGDP52209 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGDP52209 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGDP52209 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGDP52209 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PGDP52209 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGDP52209 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGDP52209 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGDP52209 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGDP52209 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGDP52209 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGDP52209 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGDP52209 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGDP52209 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGDP52209 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGDP52209 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGDP52209 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGDP52209 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGDP52209 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms