Protein–RNA interactions for Protein: P51688

SGSH, N-sulphoglucosamine sulphohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSHP51688 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSHP51688 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSHP51688 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSHP51688 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSHP51688 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSHP51688 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSHP51688 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSHP51688 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSHP51688 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSHP51688 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSHP51688 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSHP51688 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSHP51688 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSHP51688 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSHP51688 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SGSHP51688 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGSHP51688 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGSHP51688 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGSHP51688 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGSHP51688 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSHP51688 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSHP51688 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSHP51688 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSHP51688 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSHP51688 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSHP51688 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSHP51688 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSHP51688 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSHP51688 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSHP51688 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSHP51688 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSHP51688 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSHP51688 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSHP51688 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSHP51688 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSHP51688 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSHP51688 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSHP51688 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSHP51688 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSHP51688 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSHP51688 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSHP51688 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSHP51688 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSHP51688 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSHP51688 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSHP51688 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSHP51688 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSHP51688 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSHP51688 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSHP51688 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSHP51688 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSHP51688 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSHP51688 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSHP51688 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSHP51688 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSHP51688 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSHP51688 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSHP51688 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSHP51688 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSHP51688 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSHP51688 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSHP51688 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSHP51688 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSHP51688 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSHP51688 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSHP51688 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSHP51688 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSHP51688 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSHP51688 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSHP51688 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSHP51688 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSHP51688 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSHP51688 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSHP51688 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSHP51688 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSHP51688 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSHP51688 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSHP51688 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSHP51688 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSHP51688 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSHP51688 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSHP51688 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSHP51688 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSHP51688 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSHP51688 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSHP51688 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSHP51688 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSHP51688 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSHP51688 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSHP51688 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSHP51688 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSHP51688 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSHP51688 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGSHP51688 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGSHP51688 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SGSHP51688 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGSHP51688 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSHP51688 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSHP51688 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSHP51688 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms