Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VEGFBP49765 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VEGFBP49765 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms