Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms