Protein–RNA interactions for Protein: P41240

CSK, Tyrosine-protein kinase CSK, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSKP41240 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSKP41240 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSKP41240 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSKP41240 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSKP41240 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSKP41240 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSKP41240 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSKP41240 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSKP41240 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSKP41240 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSKP41240 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSKP41240 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSKP41240 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSKP41240 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSKP41240 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSKP41240 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSKP41240 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSKP41240 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSKP41240 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSKP41240 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSKP41240 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSKP41240 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSKP41240 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSKP41240 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSKP41240 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSKP41240 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSKP41240 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSKP41240 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSKP41240 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSKP41240 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSKP41240 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSKP41240 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSKP41240 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSKP41240 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSKP41240 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSKP41240 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSKP41240 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSKP41240 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSKP41240 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSKP41240 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSKP41240 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSKP41240 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSKP41240 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSKP41240 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSKP41240 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSKP41240 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSKP41240 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSKP41240 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSKP41240 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CSKP41240 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSKP41240 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSKP41240 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSKP41240 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSKP41240 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSKP41240 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSKP41240 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSKP41240 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSKP41240 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSKP41240 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSKP41240 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSKP41240 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSKP41240 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSKP41240 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSKP41240 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSKP41240 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSKP41240 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSKP41240 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSKP41240 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSKP41240 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSKP41240 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSKP41240 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSKP41240 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSKP41240 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSKP41240 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSKP41240 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSKP41240 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSKP41240 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSKP41240 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSKP41240 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSKP41240 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSKP41240 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSKP41240 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSKP41240 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSKP41240 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSKP41240 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSKP41240 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSKP41240 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSKP41240 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSKP41240 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSKP41240 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSKP41240 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSKP41240 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSKP41240 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSKP41240 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSKP41240 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSKP41240 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSKP41240 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSKP41240 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSKP41240 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSKP41240 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms