Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXD13P35453 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms