Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
THBS4P35443 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
THBS4P35443 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
THBS4P35443 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
THBS4P35443 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
THBS4P35443 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
THBS4P35443 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
THBS4P35443 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
THBS4P35443 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
THBS4P35443 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
THBS4P35443 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
THBS4P35443 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
THBS4P35443 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
THBS4P35443 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
THBS4P35443 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
THBS4P35443 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
THBS4P35443 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
THBS4P35443 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
THBS4P35443 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
THBS4P35443 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
THBS4P35443 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
THBS4P35443 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
THBS4P35443 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
THBS4P35443 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
THBS4P35443 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
THBS4P35443 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
THBS4P35443 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
THBS4P35443 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
THBS4P35443 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
THBS4P35443 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
THBS4P35443 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
THBS4P35443 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
THBS4P35443 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
THBS4P35443 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
THBS4P35443 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
THBS4P35443 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
THBS4P35443 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
THBS4P35443 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
THBS4P35443 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
THBS4P35443 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
THBS4P35443 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THBS4P35443 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THBS4P35443 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THBS4P35443 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
THBS4P35443 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
THBS4P35443 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THBS4P35443 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THBS4P35443 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
THBS4P35443 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
THBS4P35443 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
THBS4P35443 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THBS4P35443 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THBS4P35443 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
THBS4P35443 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
THBS4P35443 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THBS4P35443 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
THBS4P35443 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
THBS4P35443 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
THBS4P35443 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THBS4P35443 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THBS4P35443 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THBS4P35443 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
THBS4P35443 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
THBS4P35443 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THBS4P35443 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THBS4P35443 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
THBS4P35443 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THBS4P35443 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THBS4P35443 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
THBS4P35443 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
THBS4P35443 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
THBS4P35443 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
THBS4P35443 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
THBS4P35443 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
THBS4P35443 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
THBS4P35443 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
THBS4P35443 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
THBS4P35443 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
THBS4P35443 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
THBS4P35443 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
THBS4P35443 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
THBS4P35443 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
THBS4P35443 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
THBS4P35443 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
THBS4P35443 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
THBS4P35443 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
THBS4P35443 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
THBS4P35443 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
THBS4P35443 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
THBS4P35443 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
THBS4P35443 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
THBS4P35443 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
THBS4P35443 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
THBS4P35443 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
THBS4P35443 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
THBS4P35443 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
THBS4P35443 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
THBS4P35443 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
THBS4P35443 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
THBS4P35443 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms