Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms