Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNCP24863 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNCP24863 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNCP24863 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCNCP24863 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNCP24863 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCNCP24863 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNCP24863 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNCP24863 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCNCP24863 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNCP24863 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNCP24863 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNCP24863 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNCP24863 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNCP24863 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNCP24863 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNCP24863 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNCP24863 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNCP24863 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNCP24863 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNCP24863 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNCP24863 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNCP24863 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNCP24863 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNCP24863 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNCP24863 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNCP24863 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNCP24863 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNCP24863 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNCP24863 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNCP24863 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNCP24863 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNCP24863 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNCP24863 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNCP24863 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNCP24863 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNCP24863 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNCP24863 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNCP24863 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNCP24863 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNCP24863 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNCP24863 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNCP24863 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNCP24863 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNCP24863 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNCP24863 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNCP24863 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNCP24863 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNCP24863 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNCP24863 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNCP24863 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNCP24863 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNCP24863 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNCP24863 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNCP24863 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNCP24863 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNCP24863 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNCP24863 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNCP24863 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNCP24863 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNCP24863 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNCP24863 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNCP24863 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNCP24863 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNCP24863 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNCP24863 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNCP24863 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNCP24863 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNCP24863 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNCP24863 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNCP24863 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNCP24863 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNCP24863 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNCP24863 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNCP24863 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNCP24863 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNCP24863 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNCP24863 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNCP24863 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNCP24863 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNCP24863 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNCP24863 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNCP24863 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNCP24863 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNCP24863 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNCP24863 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNCP24863 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNCP24863 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNCP24863 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNCP24863 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNCP24863 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNCP24863 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNCP24863 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNCP24863 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNCP24863 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNCP24863 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNCP24863 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNCP24863 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNCP24863 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNCP24863 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms