Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms