Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRBP23467 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
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