Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCB4P21439 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB4P21439 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms