Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCP20941 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCP20941 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCP20941 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCP20941 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCP20941 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCP20941 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCP20941 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCP20941 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCP20941 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCP20941 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCP20941 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCP20941 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCP20941 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCP20941 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCP20941 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCP20941 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCP20941 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCP20941 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCP20941 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCP20941 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCP20941 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCP20941 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCP20941 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCP20941 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCP20941 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCP20941 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCP20941 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCP20941 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCP20941 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCP20941 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCP20941 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCP20941 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCP20941 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCP20941 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCP20941 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCP20941 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCP20941 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCP20941 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCP20941 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCP20941 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCP20941 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCP20941 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCP20941 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCP20941 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCP20941 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCP20941 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCP20941 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCP20941 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCP20941 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCP20941 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCP20941 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCP20941 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCP20941 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCP20941 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCP20941 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDCP20941 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PDCP20941 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PDCP20941 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDCP20941 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDCP20941 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDCP20941 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDCP20941 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDCP20941 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDCP20941 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDCP20941 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDCP20941 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDCP20941 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDCP20941 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDCP20941 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCP20941 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCP20941 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCP20941 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCP20941 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCP20941 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCP20941 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCP20941 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCP20941 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCP20941 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCP20941 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCP20941 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCP20941 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCP20941 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCP20941 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCP20941 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCP20941 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCP20941 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCP20941 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCP20941 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCP20941 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCP20941 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCP20941 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCP20941 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCP20941 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCP20941 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCP20941 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCP20941 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCP20941 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCP20941 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCP20941 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms