Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XBP1P17861 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
XBP1P17861 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XBP1P17861 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XBP1P17861 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XBP1P17861 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XBP1P17861 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XBP1P17861 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XBP1P17861 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XBP1P17861 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XBP1P17861 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XBP1P17861 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XBP1P17861 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XBP1P17861 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XBP1P17861 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XBP1P17861 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XBP1P17861 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XBP1P17861 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XBP1P17861 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XBP1P17861 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XBP1P17861 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XBP1P17861 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
XBP1P17861 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XBP1P17861 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XBP1P17861 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XBP1P17861 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XBP1P17861 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XBP1P17861 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XBP1P17861 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XBP1P17861 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XBP1P17861 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XBP1P17861 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XBP1P17861 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XBP1P17861 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XBP1P17861 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XBP1P17861 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XBP1P17861 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XBP1P17861 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XBP1P17861 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XBP1P17861 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XBP1P17861 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XBP1P17861 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XBP1P17861 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XBP1P17861 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XBP1P17861 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XBP1P17861 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XBP1P17861 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XBP1P17861 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XBP1P17861 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XBP1P17861 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XBP1P17861 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XBP1P17861 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XBP1P17861 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XBP1P17861 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XBP1P17861 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XBP1P17861 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XBP1P17861 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XBP1P17861 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XBP1P17861 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XBP1P17861 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XBP1P17861 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XBP1P17861 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XBP1P17861 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XBP1P17861 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XBP1P17861 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XBP1P17861 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XBP1P17861 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XBP1P17861 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XBP1P17861 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XBP1P17861 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XBP1P17861 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XBP1P17861 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XBP1P17861 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XBP1P17861 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XBP1P17861 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
XBP1P17861 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XBP1P17861 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XBP1P17861 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XBP1P17861 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XBP1P17861 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XBP1P17861 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XBP1P17861 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XBP1P17861 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XBP1P17861 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XBP1P17861 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XBP1P17861 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XBP1P17861 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XBP1P17861 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XBP1P17861 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XBP1P17861 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XBP1P17861 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XBP1P17861 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
XBP1P17861 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XBP1P17861 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XBP1P17861 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XBP1P17861 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
XBP1P17861 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XBP1P17861 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
XBP1P17861 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XBP1P17861 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms