Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms