Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB3P14651 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB3P14651 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms