Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM27P14373 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM27P14373 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms