Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC130P13994 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC130P13994 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms