Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms