Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRSS56P0CW18 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRSS56P0CW18 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.9 ms