Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna5P07349 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms