Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNSO60931 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNSO60931 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNSO60931 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNSO60931 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNSO60931 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNSO60931 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNSO60931 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNSO60931 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNSO60931 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNSO60931 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNSO60931 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNSO60931 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNSO60931 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNSO60931 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNSO60931 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNSO60931 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNSO60931 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNSO60931 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNSO60931 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNSO60931 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNSO60931 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNSO60931 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNSO60931 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNSO60931 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNSO60931 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNSO60931 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNSO60931 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNSO60931 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNSO60931 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNSO60931 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNSO60931 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNSO60931 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNSO60931 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNSO60931 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNSO60931 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNSO60931 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNSO60931 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNSO60931 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNSO60931 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNSO60931 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNSO60931 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNSO60931 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNSO60931 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNSO60931 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNSO60931 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNSO60931 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNSO60931 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNSO60931 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNSO60931 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNSO60931 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNSO60931 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNSO60931 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNSO60931 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNSO60931 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNSO60931 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNSO60931 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNSO60931 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNSO60931 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNSO60931 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNSO60931 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNSO60931 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNSO60931 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNSO60931 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNSO60931 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNSO60931 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNSO60931 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNSO60931 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNSO60931 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNSO60931 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNSO60931 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNSO60931 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNSO60931 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNSO60931 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNSO60931 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNSO60931 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNSO60931 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNSO60931 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNSO60931 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNSO60931 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNSO60931 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNSO60931 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNSO60931 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNSO60931 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNSO60931 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNSO60931 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNSO60931 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNSO60931 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNSO60931 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNSO60931 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNSO60931 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNSO60931 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNSO60931 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNSO60931 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNSO60931 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNSO60931 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNSO60931 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNSO60931 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNSO60931 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNSO60931 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms