Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SYNGR3O43761 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms