Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATCO43716 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GATCO43716 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATCO43716 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATCO43716 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATCO43716 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATCO43716 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATCO43716 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATCO43716 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GATCO43716 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATCO43716 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATCO43716 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATCO43716 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATCO43716 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATCO43716 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GATCO43716 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATCO43716 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATCO43716 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATCO43716 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATCO43716 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATCO43716 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATCO43716 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATCO43716 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATCO43716 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATCO43716 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATCO43716 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATCO43716 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATCO43716 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATCO43716 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GATCO43716 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATCO43716 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATCO43716 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATCO43716 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATCO43716 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATCO43716 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATCO43716 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATCO43716 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATCO43716 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATCO43716 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATCO43716 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GATCO43716 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATCO43716 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATCO43716 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATCO43716 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATCO43716 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATCO43716 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATCO43716 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATCO43716 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATCO43716 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATCO43716 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATCO43716 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATCO43716 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATCO43716 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATCO43716 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATCO43716 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATCO43716 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATCO43716 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATCO43716 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATCO43716 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATCO43716 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATCO43716 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATCO43716 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATCO43716 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATCO43716 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATCO43716 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATCO43716 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATCO43716 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATCO43716 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATCO43716 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATCO43716 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATCO43716 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATCO43716 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATCO43716 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATCO43716 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATCO43716 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATCO43716 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATCO43716 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATCO43716 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATCO43716 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATCO43716 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATCO43716 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATCO43716 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GATCO43716 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATCO43716 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GATCO43716 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GATCO43716 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATCO43716 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATCO43716 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATCO43716 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATCO43716 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATCO43716 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATCO43716 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GATCO43716 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATCO43716 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATCO43716 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATCO43716 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATCO43716 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATCO43716 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATCO43716 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATCO43716 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms