Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERI3O43414 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERI3O43414 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERI3O43414 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERI3O43414 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERI3O43414 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERI3O43414 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERI3O43414 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERI3O43414 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERI3O43414 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERI3O43414 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERI3O43414 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERI3O43414 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ERI3O43414 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERI3O43414 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ERI3O43414 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERI3O43414 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERI3O43414 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERI3O43414 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERI3O43414 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ERI3O43414 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERI3O43414 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERI3O43414 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERI3O43414 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERI3O43414 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERI3O43414 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERI3O43414 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERI3O43414 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERI3O43414 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERI3O43414 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERI3O43414 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERI3O43414 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERI3O43414 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERI3O43414 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERI3O43414 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERI3O43414 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERI3O43414 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERI3O43414 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERI3O43414 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERI3O43414 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERI3O43414 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERI3O43414 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERI3O43414 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERI3O43414 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERI3O43414 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERI3O43414 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERI3O43414 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERI3O43414 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERI3O43414 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERI3O43414 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERI3O43414 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERI3O43414 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERI3O43414 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERI3O43414 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERI3O43414 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERI3O43414 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERI3O43414 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERI3O43414 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERI3O43414 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERI3O43414 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERI3O43414 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERI3O43414 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERI3O43414 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERI3O43414 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERI3O43414 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERI3O43414 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERI3O43414 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERI3O43414 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERI3O43414 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERI3O43414 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERI3O43414 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERI3O43414 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERI3O43414 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERI3O43414 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERI3O43414 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERI3O43414 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ERI3O43414 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERI3O43414 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERI3O43414 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERI3O43414 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERI3O43414 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERI3O43414 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERI3O43414 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERI3O43414 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERI3O43414 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERI3O43414 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERI3O43414 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERI3O43414 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERI3O43414 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERI3O43414 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERI3O43414 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERI3O43414 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERI3O43414 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERI3O43414 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERI3O43414 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERI3O43414 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERI3O43414 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERI3O43414 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERI3O43414 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERI3O43414 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms