Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRRTM2O43300 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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