Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD28O15084 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms