Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGRNO00468 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGRNO00468 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGRNO00468 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGRNO00468 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGRNO00468 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGRNO00468 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGRNO00468 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGRNO00468 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGRNO00468 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGRNO00468 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGRNO00468 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGRNO00468 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AGRNO00468 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AGRNO00468 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGRNO00468 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGRNO00468 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGRNO00468 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGRNO00468 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGRNO00468 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGRNO00468 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AGRNO00468 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGRNO00468 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGRNO00468 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGRNO00468 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGRNO00468 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGRNO00468 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGRNO00468 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGRNO00468 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGRNO00468 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGRNO00468 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGRNO00468 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGRNO00468 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGRNO00468 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGRNO00468 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGRNO00468 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGRNO00468 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGRNO00468 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AGRNO00468 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGRNO00468 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGRNO00468 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGRNO00468 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGRNO00468 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGRNO00468 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGRNO00468 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGRNO00468 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGRNO00468 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGRNO00468 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGRNO00468 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGRNO00468 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGRNO00468 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGRNO00468 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGRNO00468 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGRNO00468 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGRNO00468 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGRNO00468 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGRNO00468 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGRNO00468 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGRNO00468 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGRNO00468 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGRNO00468 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGRNO00468 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGRNO00468 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGRNO00468 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGRNO00468 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGRNO00468 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGRNO00468 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGRNO00468 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGRNO00468 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGRNO00468 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGRNO00468 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGRNO00468 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGRNO00468 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGRNO00468 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGRNO00468 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AGRNO00468 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGRNO00468 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AGRNO00468 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGRNO00468 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGRNO00468 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGRNO00468 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGRNO00468 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGRNO00468 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGRNO00468 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRNO00468 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRNO00468 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRNO00468 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRNO00468 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRNO00468 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRNO00468 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRNO00468 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRNO00468 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRNO00468 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRNO00468 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRNO00468 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRNO00468 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRNO00468 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRNO00468 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRNO00468 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRNO00468 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms