Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DFFAO00273 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DFFAO00273 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DFFAO00273 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DFFAO00273 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DFFAO00273 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DFFAO00273 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DFFAO00273 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DFFAO00273 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DFFAO00273 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DFFAO00273 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DFFAO00273 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DFFAO00273 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DFFAO00273 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DFFAO00273 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DFFAO00273 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DFFAO00273 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DFFAO00273 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DFFAO00273 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DFFAO00273 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DFFAO00273 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DFFAO00273 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DFFAO00273 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DFFAO00273 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DFFAO00273 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DFFAO00273 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DFFAO00273 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DFFAO00273 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DFFAO00273 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DFFAO00273 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DFFAO00273 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DFFAO00273 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DFFAO00273 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DFFAO00273 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DFFAO00273 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DFFAO00273 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DFFAO00273 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DFFAO00273 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DFFAO00273 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DFFAO00273 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DFFAO00273 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DFFAO00273 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DFFAO00273 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DFFAO00273 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DFFAO00273 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DFFAO00273 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DFFAO00273 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DFFAO00273 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DFFAO00273 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DFFAO00273 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DFFAO00273 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DFFAO00273 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DFFAO00273 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DFFAO00273 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DFFAO00273 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DFFAO00273 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DFFAO00273 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DFFAO00273 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DFFAO00273 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DFFAO00273 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DFFAO00273 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DFFAO00273 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DFFAO00273 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DFFAO00273 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DFFAO00273 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DFFAO00273 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DFFAO00273 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DFFAO00273 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DFFAO00273 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DFFAO00273 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DFFAO00273 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DFFAO00273 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DFFAO00273 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DFFAO00273 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DFFAO00273 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DFFAO00273 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DFFAO00273 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DFFAO00273 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DFFAO00273 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DFFAO00273 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DFFAO00273 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DFFAO00273 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DFFAO00273 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DFFAO00273 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DFFAO00273 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DFFAO00273 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DFFAO00273 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DFFAO00273 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DFFAO00273 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DFFAO00273 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DFFAO00273 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DFFAO00273 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DFFAO00273 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DFFAO00273 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DFFAO00273 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DFFAO00273 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DFFAO00273 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DFFAO00273 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DFFAO00273 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DFFAO00273 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms